口腔不良习惯在错牙合畸形的病因中占有重要的位置，约占各类错牙合畸形病因的1/4。在儿童发育期，有效地预防和去除口腔不良习惯，可显著地减少错牙合畸形的发生。常见的口腔不良习惯有：
①吮指习惯：儿童在2岁或3岁前有吮指习惯可视为正常的生理活动，这种习惯通常在4～6岁以后逐渐减少而自行消失。在这之后继续存在则属于不良习惯，可导致明显的错牙合畸形。
②舌习惯：儿童在替牙期常用舌尖舔弄松动的乳牙、乳牙残根或初萌的恒牙，因而形成吐舌或舐牙习惯。患慢性扁桃体炎、慢性咽喉炎等疾病的儿童，为了使呼吸道畅道，常将舌向前伸，借以促进舌的功能活动从而引发伸舌习惯。
③唇习惯：唇习惯多发生在6～15岁之间，常由于儿童情绪不好，被老师或家长批评之后或模仿别人，出现咬唇动作，日久即形成咬唇习惯。
④偏侧咀嚼习惯：多发生在乳牙后期。患侧牙齿龋坏，儿童更愿意用健侧咀嚼食物，形成偏侧咀嚼习惯。可引起的错牙合如：下前牙中线变向咀嚼侧偏移，颜面左右两侧发育不对称
⑤咬物习惯：多见咬铅笔和啃指甲，可形成局部小开牙合畸形。
⑥睡眠习惯：儿童睡眠时，经常用手、肘或拳头枕在一侧的脸下，有时用手托一侧腮部读书或思考问题，都可妨碍牙、颌、面的正常发育及面部对称性。